Η μέθοδος διάγνωσης της   ενεργούς  λοίμωξης από το  στέλεχος   κορονοιού  SARS COV 2 βάση του  ECDC  ( ευρωπαϊκό  κέντρο  λοιμώξεων ) είναι η μοριακή ανίχνευση νουκλεϊκού οξέος (κύτταρα του ιού)  από ρινοφαρυγγικό δείγμα   ενώ δεν έχει αναγνωριστεί η ορολογική ( εξέταση αίματος ).

Κατάλληλο δείγμα αποτελεί το ρινοφαρυγγικό  και το  στοματοφαρυγγικό  του οποίου  η λήψη πρέπει να γίνεται   με ειδικό εύκαμπτο στυλεό  αλλά και σωστό  χειρισμό προκειμένου να παρθεί πλούσιο σε κύτταρα δείγμα. Έχουν πολλές φορές αναφερθεί  τεστ του ιού  με ψευδώς  αρνητικά αποτελέσματα , αυτό έγκειται σε λήψη πτωχού δείγματος  λόγω κακού χειρισμού ή και χρήση  ακατάλληλου  εξοπλισμού.  Αξίζει  βεβαίως  να σημειωθεί ότι σημαντική είναι  η φάση ενεργότητας του ιού , αν βρίσκεται σε αποδρομή η σε  αρχικά στάδια το ιοικό φορτίο μπορεί να είναι αρκετά χαμηλό και να μας δώσει ένα ψευδώς αρνητικό αποτέλεσμα ή ένα αμφίβολο (οριακό) . Σε αυτή την περίπτωση ο εργαστηριακός ιατρός θα πρέπει να ζητήσει ένα επαναληπτικό δείγμα προκειμένου να δοθεί η σωστή διάγνωση και να παρθούν τα κατάλληλα μέτρα