Η μέθοδος διάγνωσης της ενεργούς λοίμωξης από το στέλεχος κορονοιού SARS COV 2 βάση του ECDC ( ευρωπαϊκό κέντρο λοιμώξεων ) είναι η μοριακή ανίχνευση νουκλεϊκού οξέος (κύτταρα του ιού) από ρινοφαρυγγικό δείγμα ενώ δεν έχει αναγνωριστεί η ορολογική ( εξέταση αίματος ).
Κατάλληλο δείγμα αποτελεί το ρινοφαρυγγικό και το στοματοφαρυγγικό του οποίου η λήψη πρέπει να γίνεται με ειδικό εύκαμπτο στυλεό αλλά και σωστό χειρισμό προκειμένου να παρθεί πλούσιο σε κύτταρα δείγμα. Έχουν πολλές φορές αναφερθεί τεστ του ιού με ψευδώς αρνητικά αποτελέσματα , αυτό έγκειται σε λήψη πτωχού δείγματος λόγω κακού χειρισμού ή και χρήση ακατάλληλου εξοπλισμού. Αξίζει βεβαίως να σημειωθεί ότι σημαντική είναι η φάση ενεργότητας του ιού , αν βρίσκεται σε αποδρομή η σε αρχικά στάδια το ιοικό φορτίο μπορεί να είναι αρκετά χαμηλό και να μας δώσει ένα ψευδώς αρνητικό αποτέλεσμα ή ένα αμφίβολο (οριακό) . Σε αυτή την περίπτωση ο εργαστηριακός ιατρός θα πρέπει να ζητήσει ένα επαναληπτικό δείγμα προκειμένου να δοθεί η σωστή διάγνωση και να παρθούν τα κατάλληλα μέτρα